Bolsa de Investigação Projeto “Creating and refining whole-genome and core-genome typing schemas for pathogen surveillance – CENTAUR” – INSA

11-06-2024

O Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge (INSA), Departamento de Doenças Infeciosas, abre concurso para a atribuição de uma Bolsa de Investigação para Mestre – 1 vaga – a candidatos (M/F), no âmbito do Projeto “Creating and refining whole-genome and core-genome typing schemas for pathogen surveillance (CENTAUR)”, financiado pela Comissão Europeia através do Programa ISIDORe JRA. Os interessados devem apresentar a sua candidatura até ao dia 25 de junho.

Este trabalho de investigação será realizado no âmbito do projeto CENTAUR, um projeto que pretende abordar as atuais limitações para o rápido desenvolvimento e ampla adoção de esquemas de wg/cgMLST na vigilância de bactérias patogénicas e na deteção de surtos. Os seus principais objetivos são o desenvolvimento e aperfeiçoamento de ferramentas inovadoras para a criação e validação de esquemas de wg/cgMLST de elevada qualidade para bactérias patogénicas de relevância, incluindo uma hipotética bactéria X.

O INSA está particularmente envolvido no desenvolvimento e aperfeiçoamento de uma ferramenta para a comparação automática da congruência dos clusters obtidos e da performance na deteção de surtos das workflows de vigilância baseadas em wg/cgMLST, incluindo aquelas que utilizarão os esquemas desenvolvidos no âmbito do projeto CENTAUR. Desta forma, o plano de trabalhos para esta Bolsa de Investigação focar-se-á no desenvolvimento dos componentes associados ao reporting, incluindo a produção de outputs e a visualização dos resultados orientados para o utilizador.

A bolsa terá a duração de 12 meses, com início previsto para julho de 2024 e término a julho de 2025. O trabalho será desenvolvido na Unidade de Genómica Bioinformática do Departamento de Doenças Infeciosas do INSA, em Lisboa. Para mais informações, consultar aviso de abertura do concurso.

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